I genetisti tracciare l'evoluzione di St. Louis Encefalite

Marzo 16, 2016 Admin Salute 0 1
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Prima di virus West Nile è arrivato in questo paese, abbiamo avuto (e hanno ancora) un home-grown relativo di questo patogeno. Un'epidemia di origine sconosciuta è esploso vicino a St. Louis, Missouri, nell'autunno del 1933, una malattia che ora è conosciuto per essere trasmessa dalle zanzare dagli uccelli alle persone. Ora, una nuova analisi del genoma di St. Louis encefalite completato presso l'Istituto per la Sackler Comparative Genomics presso il Museo Americano di Storia Naturale (AMNH) è mettere in luce l'evoluzione di questo virus.

Sotto la direzione di Susan Perkins, Assistente Curatore di genomica microbica, borsisti postdottorato Gregory Baillie, Sergios-Orestis Kolokotronis, e Eric Waltari sequenziato l'intero codice genetico di 23 ceppi del virus che causano St. Louis encefalite, tutto dal genere flavivirus. La ricerca precedente aveva trovato che la ricombinazione (taglio e incollatura di trefoli di materiale genetico, in questo caso RNA) spiegato l'evoluzione di questo virus, ma questi studi sequenziati solo un singolo gene del virus.

Perché l'approccio dell'intero genoma girato un microscopio l'intero set di istruzioni per St. Louis encefalite, i ricercatori AMNH sono riusciti a determinare che una singola mutazione nel codifica per una proteina dell'involucro anziché ricombinazione probabilmente causato cambiamenti che hanno reso il virus patogeni per l'uomo. "La ricombinazione è importante per la malattia, ma rende nuove proteine ​​o geni che il sistema immunitario non ha mai visto prima", spiega Perkins. "Ma in questo caso, era dinamica di popolazione combinati con lievi modifiche nella forma di mutazioni puntiformi che sono stati importante nell'evoluzione di questo virus."




L'analisi genetica ha permesso anche Perkins e colleghi di tracciare il percorso evolutivo del virus flavivirus. Hanno determinato che i più anziani, meno tensioni derivate, o ceppi più ancestrali, sono dal Sud America. I ceppi del Nord America e haitiani sono stati passati da host di uccelli comuni come fringuelli, pettirossi, ghiandaie blu e colombe in esseri umani dalla zanzara Culex dopo che il virus è esplosa in un nuovo continente. Per ora questo evento, i ricercatori di nuovo rivolto al codice genomica: dalla determinazione del tasso di mutazione del virus, Perkins ha rilevato che la divisione tra il Sud e le tensioni in Nord America avvenne circa 116 anni fa. "St. Louis encefalite è una tempesta perfetta tra host di uccelli infetti che entrano in una nuova area e le zanzare vettori di trasferimento del virus agli esseri umani", dice Perkins. "E 'la versione nordamericana del West Nile."

St. Louis encefalite è attualmente presente in tutto gli Stati Uniti, e, secondo i Centers for Disease Control, ci sono stati 4.651 casi tra il 1964 e il 2005. I sintomi variano da un lieve mal di testa alla febbre alta e tremori. La mortalità è tra il 5 e il 30% ed è maggiore tra gli anziani.

Questa ricerca è stata pubblicata nel numero di maggio della rivista Molecular Phylogenetics e Evolution. Coautori aggiuntivi sono Giuseppe Maffei e Laura Kramer da Arbovirus Laboratori del Dipartimento della Salute dello Stato di New York. La ricerca è stata resa possibile dal Laboratorio di ricerca dell'esercito americano, il Research Office US Army, il Wadsworth media center e facility Tissue Culture, e il Centro di riferimento mondiale per emergenti virus e arbovirus attraverso l'Università del Texas Medical Branch a Galveston, la Biologia Computazionale Unità di servizio presso la Cornell University, e CamGrid presso l'Università di Cambridge.

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