La nuova tecnica è chiamata in situ fluorescente dosaggio proteina gene. Esso combina fluorescente tradizionale ibridazione in situ (FISH) con il test in situ legatura di prossimità, che è in grado di risolvere molecole proteiche individuali.
"A mia conoscenza, questa è la prima tecnica che ci permette di affrontare contemporaneamente l'attività dei geni e l'espressione della proteina corrispondente nelle stesse cellule," dice il co-investigatore principale Dr. Arnab Chakravarti, sedia e professore di radiazione oncologia e co-direttore del Brain Tumor Program presso la Ohio State University Comprehensive Cancer Center - Arthur G. James Cancer Hospital e Richard J. Solove Research Institute (OSUCCC - James).
"La capacità di risolvere gene e proteina-espressione cambia attraverso un tumore potrebbe aiutarci a capire che cosa spinge il comportamento del tumore globale", dice Chakravarti
Il nuovo test è descritto nel numero di agosto della rivista Neuro-Oncology. Per questo studio, ricercatore principale Dr. Markus Bredel, professore associato presso l'Università di Alabama Birmingham, e un associato di oncologia di radiazione aggiunto professore al OSUCCC - James, insieme a Chakravarti e loro collaboratori prima analizzati cellule tumorali di glioblastoma umano fissi, quindi incluso in paraffina glioblastoma umano. In entrambi i casi, i ricercatori analizzati per sovraespressione di una forma mutante del gene del recettore del fattore di crescita epidermico, EGFRvIII, e livelli della sua proteina troncata in glioblastoma.
"Questo metodo ha il potenziale per eseguire un'analisi dettagliata del rapporto tra stato del gene del cancro e di espressione delle proteine corrispondenti in cellule e tessuti", dice Bredel. "Abbiamo dimostrato che la fluorescenza in situ metodologia gene assay proteina è in grado di risolvere modelli gene del cancro e proteine contemporaneamente su base cella per cella, che è particolarmente importante nelle malattie eterogenee tali tumori."
Le implicazioni del saggio sono i seguenti:
- E 'particolarmente rilevante per la ricerca sul cancro a causa del ruolo di regolazione epigenetica e posttranscriptional. Li>
- La capacità di correlare gene e informazioni proteine nelle stesse cellule potrebbe aumentare l'affidabilità degli schermi biomarker. Li>
- Potrebbe aiutare a prendere decisioni terapeutiche quando lo screening per il solo gene o dei rendimenti proteine risultati indeterminati. Li>
- Può essere applicato agli studi gene-trasfezione che utilizzano modelli 'knock-in "per studiare gli effetti del numero gene sull'espressione della proteina. Li>
"Crediamo che questo saggio è ampiamente applicabile per malattia oriented e cell- e ricerca molecolare-biologia", dice Chakravarti.
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