Tecnologia DNA-scanning trova possibili Siti dei geni del cancro nei cromosomi di Lung Cancer Cell

Maggio 8, 2016 Admin Salute 0 7
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Con apparecchiature progettate per sondare i più piccoli segmenti del codice genetico, i ricercatori del Dana-Farber Cancer Institute e le istituzioni che collaborano hanno trovato qualcosa di molto più grande: le sezioni dei cromosomi delle cellule tumorali del polmone dove i geni correlati al cancro possono annidarsi.

In uno studio del 1 luglio della rivista Cancer Research, i ricercatori hanno utilizzato polimorfismo a singolo nucleotide (SNP), la tecnologia di array, che si concentra sui blocchi di costruzione di singoli geni, per identificare le regioni dei cromosomi in cui i geni erano o lasciati fuori o moltiplicate over e oltre - errori che sono spesso associati con il cancro. In questo sforzo, SNP (pronunciato "snip") array sono stati utilizzati per trovare gli errori gene-copia nelle cellule tumorali del polmone.

"In uno studio precedente, abbiamo dimostrato che gli array SNP offrono un modo unico di localizzare copia-numero cambiamenti di cromosomi delle cellule e di determinare quando i geni su una coppia di cromosomi non corrispondono", dice l'autore senior dello studio, Matthew Meyerson, MD, PhD , di Dana-Farber. "L'attuale studio dimostra che la tecnologia ad alta risoluzione SNP è abbastanza potente per identificare copia-numero alterazioni che in precedenza non erano stati trovati in cellule del cancro del polmone."




Lavorare con 70 campioni di tessuto del cancro del polmone e 31 linee di laboratorio cresciuto di cellule tumorali del polmone, i ricercatori hanno utilizzato macchinari ad alta risoluzione per la scansione cromosomi delle cellule 'in 115.000 punti. Essi hanno scoperto diverse aree che erano già state identificate come aventi errori di copia-numero, più cinque nuovi - due in cui erano stati cancellati i geni, e tre dove erano stati altamente over-copiato.

Il prossimo passo sarà quello di identificare i geni specifici coinvolti in queste alterazioni. Che, a sua volta, potrebbe portare a nuovi test diagnostici e trattamenti per il cancro del polmone, di gran lunga la forma più comune di cancro negli Stati Uniti, e uno dei più difficili da trattare.

C'è una crescente evidenza che le terapie volte a specifiche anomalie genetiche possono essere efficaci nel trattamento del cancro. L'anno scorso, per esempio, Meyerson e colleghi hanno dimostrato che il farmaco Iressa si è ridotto tumori nei pazienti con la forma più comune di cancro al polmone che portano un'anomalia, o mutazione di un singolo gene.

Meyerson sottolinea che la presenza di copia-numero di modifiche non garantisce che i geni nelle regioni individuate sono coinvolti nel cancro. "Avremo bisogno di caratterizzare i geni in queste regioni nel dettaglio per capire il loro ruolo e se sono cancerogene o geni del cancro-prevenzione", osserva.

Co-autori dello studio sono Barbara Weir, PhD, Thomas LaFramboise, MD, Ming Lin, Rameen Beroukhim, MD, PhD, Levi Garraway, MD, PhD, Javad Beheshti, MD, Jeffrey Lee, Pasi Janne, MD, PhD, Cheng Li, PhD, e William Sellers, MD, del Dana-Farber; Katsuhiko Naoki, MD, PhD, del Ospedale di Yokohama comunale cittadino a Yokohama, in Giappone; William Richards, PhD, David Sugarbaker, MD, Fei Chen, e Mark Rubin, MD, del Brigham and Women Hospital; Luc Girard, PhD, e John Minna, MD, della University of Texas Southwestern Medical Center a Dallas; e David Christiani, MD, della Harvard School of Public Health.

Lo studio è stato finanziato in parte da sovvenzioni dal National Institutes of Health, il National Cancer Institute, l'American Cancer Society, il Flight Attendant Medical Research Institute, e Arthur e Rochelle Belfer Fondazione.

Dana-Farber Cancer Institute è un insegnamento principale affiliato alla Harvard Medical School ed è tra i principali centri di ricerca e cura del cancro negli Stati Uniti. E 'uno dei membri fondatori della Dana-Farber/Harvard Cancer Center (DF/HCC), designato un cancro al centro dal National Cancer Institute.

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